AugeGreen qPCR染液,20× in water

产品货号: S2007S/S2007L
应用范围: 实时定量 PCR、荧光染料、核酸检测
产品规格: 1 mL 5 mL
价 格 :
408
数  量:
- +
  • 说  明  书: S2007S/S2007L

产品介绍

产品货号:S2007S / S2007L

产品规格:1mL/5mL

储存条件:-20℃避光保存,有效期见外包装

应用范围:实时定量PCR、高分辨率溶解曲线

产品参数

λabs/λem = 500/530 nm(结合DNA)

λabs = 471 nm(未结合DNA)

产品介绍

AugeGreen是一种用于实时定量PCR(qPCR)的DNA结合染料。该染料的诸多优点使它远胜于SYBR Green I。除了有相似的光谱特性,AugeGreen有三个主要特点使它区别于SYBR Green I。

首先,AugeGreen对PCR的抑制性远小于SYBR Green I。因此,使用AugeGreen进行的qPCR实验可以使用快速PCR步骤。同时,AugeGreen在实验中可以使用较高的浓度,从而获得远强于SYBR Green I扩增信号。较高浓度的AugeGreen也消除了“染料重分布”的缺陷,使AugeGreen既可用于多重PCR,也可用于高分辨率(高清晰)熔解曲线分析(HRM)。该分析正被越来越多的用于PCR后的基因分型和异源双链分析。由于SYBR Green I对PCR的抑制性,从而要求其使用浓度必须很低,因此SYBR Green I无法解决由低浓度造成的染料重分布问题,既不能用于多重PCR也不能用于HRM。同时,染料重分布问题也可能影响常规熔解曲线的可靠性,因为低熔点的DNA链可能由于这种原因而无法检测到。

第二,AugeGreen的稳定性极强。在正常的储存、操作和PCR过程中不会被破坏。在缓冲溶液中的染料可以安全的储存在室温或冰箱里,也可以反复冻融。与之相反,SYBR Green I不稳定而且降解后对PCR抑制性更强。

第三,AugeGree降低了细胞膜透性,因而比SYBR Green I更加安全。独立实验室的测试结果显示,AugeGreen既没有诱变性也没有细胞毒性。相反,虽然SYBR Green I本身诱变性很弱,但它在细胞中可能抑制了正常DNA的修复机制,使其有诱变增强作用。考虑到PCR的广泛使用,其安全性应该足够重视。

AugeGreen染料特性

1. 光谱特性

图1. 在TE缓冲液中,结合到双链DNA中AugeGreen染料的

激发光谱(蓝色)和发射光谱(红色)

2. SYBR Green I与AugeGreen荧光染料的稳定性比较

图2. AugeGreen、SYBR Green I的吸收光谱1.2 µM, pH9的Tris缓冲液中,99℃孵育3 h后,两种荧光染料溶液的相对荧光强度,ROX作参照物

3. 染料的稳定性

Ames实验显示,AugeGreen染料没有细胞毒性和致突变性,该染料不具细胞膜渗透性(图3),这是其低细胞毒性的一个关键因素。相反地,众所周知,SYBR Green I荧光染料具有很强的致突变性,可能原因是其抑制了细胞内DNA修复机制(Ohta, etel. Mutat. Res.492, 91(2001)),而SYBR Green I较强的细胞毒性是由其较高的细胞膜渗透性所导致的(图3)。

图3. 37℃条件下,用SYBR Green I或AugeGreen(1.2 µM)孵育HeLa细胞,分别在5 min或30 min后拍照,观察荧光强度。SYBR Green I 迅速渗透进入细胞,然而AugeGreen几乎不具有细胞膜渗透性。

使用方法

1. 如下建立实验体系:(仅供参考)

名称 体积
10×的无Mg2+聚合酶缓冲液 5 µL
50 mM MgCl2 2.5 µL
2 mM dNTP 5 µL
20×AugeGreen工作液 2.5 µL
Taq DNA polymerase 1-5 units
F, R Primers 各0.1-0.5 µM
模板 适量
dH2O to a final volume of 50 µL

注:a. DNA模板的添加量通常在100 ng以下。因不同种类的DNA模板中含有的靶基因的拷贝数不同,必要时可进行梯度稀释,确定合适的DNA模板添加量。cDNA作为模板时的添加量不要超过PCR反应液总体积的10%。b. 引物终浓度一般控制在0.1-0.5 μM范围内。

2. 在qPCR仪器上进行实时荧光定量PCR并获得荧光在退火或延伸步骤中使用SYBR Green或FAM通道。

注意事项

1. qPCR仪器:对于iCycler的用户,不需要在PCR Mix里面额外添加FAM。由于AugeGreen有轻微的背景荧光,它可以作为充足且稳定的校准基线来使用。对于Roche Light Cycler的用户,如果使用玻璃毛细管进行反应,那么需要在反应体系中额外加入BSA(终浓度~0.5 mg/mL);如果使用透明的塑料毛细管,则不需要添加BSA。

2. 熔解曲线分析仪器:Rotor-Gene 6000, ABI 7500 FAST, HR1™, 384-well LightScanner™, Roche LightCycler 480, Rotor-Gene 6000, ABI 7500 FAST和Roche LightCycler 480等仪器都可以用于qPCR和熔解曲线的分析。具体参照仪器生产商的使用说明进行数据的采集和分析操作。

3. 扩增片段长度:推荐的DNA扩增长度为50-200 bp,如果需要扩增更长的DNA片段,那么需要适当延长PCR的反应时间。

AugeGreenTM 使用说明(仅供参考)

实验目的

实时定量PCR检测20×AugeGreen

主要试剂

1. Prime

hβ-actin:forward 5’-CACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3’;reverse 5’-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3’

2. HS Taq DNA Polymerase: Thermo(EP0612)

3. Glycerlo: Sigma(V900090-500 mL)

4. BSA: Sigma(A7030)

5. 10 mM dNTPs: Takara(4019)

实验方案

1. 配制2×AugeGreen Buffer

组分 浓度 体积(μL)
1 M Tris HCl pH8.5 50 mM 5
500 mM (NH4)2SO4 20 mM 4
50 mM MgCl2 7 mM 14
50% glycerol 2.5% 5
DMSO 10% 10
20×AugeGreen 10
10 mM dNTPs 0.4 mM 4
2% Tween20 0.03% 1.5
1 mg/mL BSA 22 mg/mL 2.2
H2O / 44.3
Total volume / 100

2. 配制q-PCR反应体系

成分 20 μL/体系/管反应
10 μM primers 1 μL
模板 适量
HS Taq DNA 酶(5 U/μL) 0.2 μL
2×AugeGreen buffer 10 μL
H2O 定容至20 μL

注:a. DNA模板的添加量通常在100 ng以下。因不同种类的DNA模板中含有的靶基因的拷贝数不同,必要时可进行梯度稀释,确定合适的DNA模板添加量。cDNA作为模板时的添加量不要超过PCR反应液总体积的10%。b. 引物终浓度一般控制在0.1-0.5 μM范围内。

3. 实验分组:标准对照样品孔(阳性对照)、检测样品孔、空白对照孔(阴性对照)共三组,同时进行检测,分别进行三次平行实验。

4. 混匀离心、上机进行荧光定量PCR(仪器为Roche:LC96)。

PCR程序

温度 时间
Step 1 95℃ 2 min
Step 2 95℃ 5 sec
Step 3 60℃ 30 sec
Step 2~3,重复45个循环
熔解曲线Tm值57℃~99℃

5. 保存数据,判断样本质量

A.检测样品与标准品之间的Ct值差

B.检测样品与标准品之间的荧光强度差

检测结果需达到:以上两组检测指标无显著性差异。

FAQ

已发表文献

S2007S/S2007L

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